拜占庭皇帝的战斗部队连在长度约步行五个多小时的拜占庭城墙上布防还不够，但是这个城市靠着它的防御工事对仍然不熟练的奥斯曼炮兵进行了差不多两个月之久的抵抗。直到1453年 5月29日敌人发动了正面总攻击后才攻入这座城。康士坦丁九世在巷战中阵亡。接近中午时，穆罕默德本人在城中出现，下令军队停止屠杀，正式占领圣索非亚教堂，将它改爲清真寺。卡拉塔的热内亚人，由于在围城中一直保持中立，被准许在有利的条件下投降。这些条件保证他们在缴出所有的武器后得到了生命和财産的保障，在缴纳一切合法捐税后得享有贸易的自由。
西方的基督教国家决定派遣舰队援助拜占庭，但是已经太迟了。这支舰队驶抵内格罗旁特港时刚好听到君士坦丁堡陷落的消息在穆罕默德定都帝国的天然中心君士坦丁堡之前，他于1453年回到了亚得里安诺堡等候君士坦丁堡遭受破坏的防御工事的修复。但是他立即规定了被征服的希腊人的地位。正如他的祖先未干涉保加利亚人的宗教制度一样，他也承认希腊教会的全部权力，因爲这样作完全符合古代的伊斯兰教政治家风度的概念，这种概念是得到宗教传统的认可的。事实上他甚至于扩大了希腊教会的权力，把对教民的民事审判权也授给了他们。
穆罕默德当时最关心的是如何增加首都的大爲削减的人口。在他任命了一个希腊教会的一个坚定代表爲大主教之后，许多在大难来临之前离开的希腊人，回应他的号召回到了他们的家乡。他们在金角湾西岸人主教府邸的周围住了下来。他们依靠经商得来的财富以及他们的技能，一直使他们处于被优待的地位。这些希腊人的技能后来使奥斯曼人政府在和西方国家交往中离不开他们。此外，穆罕默德也强迫他的帝国中其他民族的代表在首都定居下来，特别是大批的南部斯拉夫人。
但是亚洲的穆斯林也蜂拥地来到这个新的帝国中心——大多数的伊斯兰教的信徒在越来越大的程度上逐渐受到了它的吸引。他们来到这个城市是爲了要获取它的得天独厚的地位所带来的商业利益，特别是爲了要利用穆罕默德和他的继承人所慷慨设立的宗教基金来从事学术研究。伊斯坦布尔不久就变成了伊斯兰教的文化中心。
这个城市被征服以后，就立即决定把圣索非亚教堂作爲主要的清真寺，这个教堂只需要略加改建就适用于举行伊斯兰教仪式。由于正统的伊斯兰教禁止给任何生物画像，成爲拜占庭艺术特点的绘在教堂拱形圆顶上的堂皇富丽的涂金彩画就不得不涂上石灰。在教堂东面的半圆形后殿中的中间和南面窗口之间修造了“米海拉卜”即朝着麦加祈祷的方向的壁龛。在壁龛的右边教堂中东南方的大圆柱上，修建了爲星期五讲道而设的讲坛。讲坛对面是苏丹的带有涂金的格子花样的专席。在清真寺的墙壁上和圆柱上的巨大的圆形盾牌上以绿地金字写着真主、先知穆罕默德和最初的几个哈里发的名字，有些字有九公尺高。不过这是在穆拉德四世的时代（1623—1640年）才开始有的。教堂外部改建爲清真寺的特征是召唤祈祷所用的尖塔。第一座尖塔是穆罕默德自己下令修建的在赛里木二世和他的继承人的时期又增建了三个。赛里木二世也在大拱顶上修建了一个直径三十公尺的青铜制的新月。正如增建的埋葬主教的小教堂使许多日尔曼式的圆屋顶的原有轮廓走了样一样，经过了一个时期之后，阿亚索非亚清真寺也淹没在各种各样的附加物——陵墓和学校，特别是支衬的建筑物——之中了。
但是穆罕默德也认爲对统治者来说，修建新建筑物是他的最重要的职责。他下令让希腊建筑师克里斯托都洛斯在城市中心，过去皇帝的墓地使徒教堂的旧址上建立起以他的名字命名的清真寺（名穆罕默德耶或称苏丹穆罕默德·法提·贾米）。这个于1463乍至1469（1473）年间修建的清真寺成爲奥斯曼建筑中最完美的纪念物。但是原有的建筑屡次爲地震所破坏，最近一次是在1767午。因此，今日的建筑只能够约略表现出原有建筑的设计。正如戈尔利特所证明的，穆罕默德把使徒教堂和索非亚教堂的轮廓混合起来修建了这个清真寺。清真寺十字形的内部覆以巨大的中央圆顶，这个圆顶由在四个同样宽的半圆形屋顶之间的四个圆柱支撑着。清真寺的四角有四个较小的圆顶。从六排上下排列的窗户照射进来的明亮的光线使清真寺内部通明透亮。两个细长的尖塔高耸于清真寺上。清真寺和毗连的学校、澡堂、餐厅、一所所谓“汗”（爲外国商人准备的下榻处）、一所贫民收容所和医院等附属建筑物占了古老的桥对面小山的整个山峰。正门右面的一块大理石板上用金字刻着现在已经实现了的先知预言：“他们定会征服君土坦丁堡，祝完成这件事业的君王和军队幸福！”
除了另外十个清真寺之外，穆罕默德于1459年在殉道者艾卜·艾优卜·安萨里的坟墓附近也修建了一个清真寺，这位殉道者在678年阿拉伯人第一次进攻君士坦丁堡时牺牲。在最后一次围城开始时，舍赫·阿克·香斯·丁于梦中在科斯米狄翁郊区附近“发现”了这座坟，因而鼓动了军队的宗教热情。在这个完全用白色大理石造成的清真寺附近就是这位殉道者的陵墓——一个质朴、四方形，没打侧边楹问的圆顶建筑物。苏丹们在登基之后就在这个陵墓小正式山布尤克·舍来比，即迈伍莱威斯托钵僧教派的教长佩以奥斯曼之剑。一些苏丹和他们的亲属以及高官显贵们就埋葬在附近。各个清真寺不久又附设了藏书丰富的图书馆，三种珍贵的伊斯兰教着作空前大量地流入这些图书馆。此外也增建了附有教授和学生宿舍的学校、医院、贫民施食站、旅店、澡堂和井一苏丹和他们的大臣们争先恐后地竞相开设这些公共企事业机构或设施。
首都中最重要的非宗教建筑的设计也渊源于这位征服者。他修复了城墙，并且在城西南端靠近马尔马拉海的地方建造了七塔堡（耶迪·古利），这个宫堡后来成爲国家监狱，有时欧洲大国的大使也被囚禁于其中。穆罕默德在海港中修建了造船厂和兵工厂，甚至市场也是他所建造的。1454年，他在城内一个小山上开始建造他的皇宫塞腊伊宫，这个皇宫后来成爲塞腊斯克（军政大臣）的官邸。1464年，他在城东端马尔马拉海浪涛冲击的地方开始修建一座新宫，这是过去希腊皇帝一直居住的地方，直到曼纽尔·康尼纳斯时才把他的大本营移到法纳尔河北岸金角湾上的勃勒休乃。从这位征服者的时代一直存留到今天的唯一非宗教建筑就是奇尼里（彩瓷）塔，这个塔于1466年兴建，1472年完工，1599年时又重建。今天这个塔中收藏着国立博物院的一部分珍藏。
穆罕默德的政策的第一个目标就是在巴尔干半岛北部巩固他的统治，因爲他在那里的统治仍然受到邻近的好战的马扎儿人的威胁。爲了取得一个对付马扎儿人的巩固的作战基地，他必须结束塞尔维亚人的独立。他强迫以前的拉扎赖维奇王朝的一个王族和他结亲，这样就有了亲戚关系爲这件事提供了藉口。1454年，当他以此爲理由要求国王格奥尔吉·布兰科维奇交出他的国家时，这位国王逃到了匈牙利的洪亚迪那里。虽然马扎儿人把奥斯曼人从他们一度占领的塞门德里亚要塞赶了出去，并且在克鲁晓瓦兹大败穆罕默德的菲劳兹·贝格将军，他们不得不以守住多瑙河一线爲满足，因爲他们期待的欧洲援军并未到来。1456年穆罕默德亲自率领大军从陆路上包围了贝尔格莱德。但是洪亚迪率领一支由十字军战士、主要是受到修道士加比斯特兰诺的感召的下层社会的人组成的杂色部队跨过多瑙河进入被围的城市。6月22日他在一场血战中击退了奥斯曼人的一次主力进攻。穆罕默德本人在这次战役中受了重伤，被迫率领军队回到索非亚。但是在这一年中，贝尔格莱德的两位英勇的保卫者都逝世了——洪亚迪死于8月14日，加比斯特兰诺死于10月23日。两年后，格奥尔吉·布兰科维奇也去世了，他的后嗣在继承权问题上发生了倾轧。这时，穆罕默德毫不费力地征服了塞尔维亚。他用屠杀、奴役和迁移到帝国其他地方去的办法粉碎了塞尔维亚人民的力量。
同时，穆罕默德在伯罗奔尼撒半岛向佩利奥洛格斯诸帝发动了进攻，因爲后者联合阿尔巴尼亚的格奥，卡斯特里奥塔背叛了他。这个地方在骇人听闻的暴行中平定了下来，这些暴行与年俱增地给予穆罕默德越来越大的乐趣。
同年他也消灭了小亚细亚的最后一个希腊王朝——特里比桑德的康奈尼王朝。直到那时，康奈尼王朝还在期待着白羊土库曼族的乌宗·哈桑可汗的帮助。乌宗·哈桑从他的部族驻地狄雅培基尔出发，和他的敌手黑羊土库曼族（黑羊部族信仰十叶派而白羊部族是逊尼派教徒）进行战争，从而在亚美尼亚建立了相当大的国家。后来，他在打败黑羊部族之后又取得了波斯和美索不达米亚。 1458年，特里比桑德的康奈尼王朝最后一位君主戴维把他的侄女凯塞琳（他的哥哥前王卡罗—琼奈斯的女儿）许配给乌宗·哈桑。早在1457年和1460年时，乌宗·哈桑就通过他在君士坦丁堡的使节宣布他要取得小亚细亚东部的霸权。当穆罕默德忙于平定西诺皮的伊斯芬迪亚尔奥格鲁的叛变时，乌宗·哈桑向奥斯曼人的领土进攻，并且劫掠了托卡特和阿马西亚周围的地方。1461年春穆罕默德腾出手来之后，他立即向土库曼人发动进攻。在乌宗·哈桑的先锋部队被艾哈迈德帕夏打败之后，他就不敢把乌合之械钠锉贸隼春褪だ男戮痪龃菩邸Ｋ哪盖兹啥卦谝郧暗某逋恢兄っ魇且晃挥胁鸥傻耐饨患摇Ｕ獯嗡咨砝吹侥潞蹦碌挠校捣四潞蹦率顾辉傧蛩亩咏ァ５撬隣懱乩锉壬５抡】泶蟠淼呐θ次闯晒Α０滤孤苏剂炝苏飧龀鞘校炎詈笠桓龌实酆退墓笞迕且黄鸱胖鸬揭了固共级汛蠖嗍木用穸贾事魻懪５钦绞ふ甙岩徊糠滞跏也票桓巳啥兀┧南备臼褂谩�
穆罕默德在伯罗奔尼撒半岛的活动已经使他多次和威尼斯发生冲突，威尼斯是在希腊领土上的唯一的仍然能够对他进行抵抗的国家。这场早已不可避免的战争由于一些微不足道的琐事终于在1462年秋天爆发。战争的主要负担落在格奥尔吉。卡斯特里奥塔的肩上。穆罕默德亲自出征，于1466年在克罗雅特将格奥尔吉包围。两年之后格奥尔吉逝去，阿尔巴尼亚人的独立也就丧失了。穆罕默德在阿尔巴尼亚人的领土上的中心地方建立了巴桑据点。随后威尼斯人自己也感到了奥斯曼人的压力。1470年夏天在一场艰苦的围攻之后，威尼斯人失去了优卑亚岛上的内格罗旁特城，这个城市在他们手中已经有二百六十四年之久。
但是威尼斯的执政者又找到了一个对抗奥斯曼人的盟友。 1467年乌宗·哈桑征服了波斯，直到这时他的敌手黑羊部族的可汗贾汗沙一直占有着这个地区。贾汗沙向乌宗·哈桑的部族老家狄雅培基尔发动进攻，但是于1467年11月11日被乌宗·哈桑打败，在逃亡时死于非命。在乌宗·哈桑南下围攻巴格达时，贾汗沙的儿子哈桑·阿里得到了帖木儿后代艾卜·赛义德的帮助。1468年3月，艾卜·赛义德从呼罗珊出发占领了伊拉克北部（属于波斯）所有地方。随后他企图把乌宗·哈桑赶出卡拉巴格。但是当他包围了阿拉斯河下游南岸草原上的马木达巴时，他被俘虏并且玻送交给一个世仇杀死。哈桑·阿里在哈马丹被乌宗·哈桑的军队杀死，乌宗·哈桑于是长驱直入占领了整个波斯。威尼斯人在 1463年已经派遣使节到乌宗，哈桑那里，争取他结盟对抗奥斯曼人。1471年这位使节在一个土库曼使臣陪同下回到了威尼斯。随后加特里诺·齐诺（他的母亲是乌宗·哈桑的特里比桑德妻子的妹妹）被派遣到大不里士。同年，威尼斯的执政者派遣吉奥萨弗·巴巴劳在乌宗·哈桑的一个使臣陪同下前往波斯。巴巴劳出发时带着六门大型臼炮、六百支步枪以及滑膛枪和弹药，由二百名士兵川军官护送。但是他只到达了塞浦路斯岛，在那里毛瑟尼高指挥下的一支威尼斯舰队正在沿着小亚细亚的南岸活动，并且占领了沿岸的一些地区。 1472年乌宗。哈桑派遣一支军队从狄雅培基尔进入奥斯曼领土，在托卡特和开塞利大肆劫掠。穆罕默德在和土库曼人交换了一些措词越来越尖锐的照会之后，于1473年3月亲自率兵前往小亚细亚。乌宗·哈桑在埃尔津疆建立了大�