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由于人员缺乏，许多仅经过3周培训的医疗护理员也参与做大量的截肢手术，军医只负责“用粉笔给这些伤员的切口画上标记”。这类“手术”的存活者几乎没有，而切下来的残肢断腿和器官则堆积成山。伤员和大量的感染病人混住在一起。许多伤员还是未成年的新兵。
尽管如此，法国军队里仍然没有有效的医疗卫生组织存在。图里奥最后说道：“随着战争的升级和武器的更新，军队的医疗护理必须跟上作战的要求。”幸运的是，图里奥又添了一句：“皇帝陛下的伟大功勋绝不会因为法国军人的流血、流泪和极大痛苦而有丝毫影响。”
法国的香巴尼和奥地利的梅特涅于8月18日在阿尔腾堡开始和平条约的谈判，但是奥地利讨价还价，谈判毫无结果。9月9日，拿破仑再也不能忍受“阿尔腾堡的闹剧”了。当弗朗西斯一世派他的使者前来见拿破仑时，拿破仑给奥地利国王带去了令他发抖的强硬口信：如果奥地利接受拿破仑的条件，还可以保有自己的领土，否则他将从哈布斯堡手中剥夺走更多的领土。拿破仑可以惩罚有千年历史的神圣的罗马教皇，也可以将奥地利王国从版图上抹去。目前，弗朗西斯一世是拿破仑在欧洲大陆上最顽固的对手，拿破仑要让他俯首帖耳。
但是，弗朗西斯一世不甘心付出拿破仑在条约中提出的如此巨大的代价，他拒绝考虑逊位的问题，为此他继续与拿破仑讨价还价，反复恳求放宽一些条件；但胜利者毫不让步，谈判一直拖延下去。与此同时，奥地利私下派出使者和沙皇谈判，但是使者从圣彼得堡空手而回——法国皇帝的胜利吓退了所有的人——普鲁士和俄国口头上都声称支持奥地利国王， 但目前他们都无能为力。
由于领土被占，普鲁士人的反法情绪日益高涨，据富歇报告拿破仑说：普鲁士国王派往巴黎的外交使节对法国的态度十分强硬。“那么就将他驱逐出境！”法国皇帝这样指示他的警务大臣。
普鲁士的首相警告皇后路易莎：“如果国王不顺乎民意马上下决心和法国对抗，一场革命将在所难免。”
事实上，不仅普鲁士和德意志，整个欧洲都处在一触即发的危机之中，因为几乎整个欧洲都受到了法国刺刀的威胁。由于国王热罗姆的昏庸，特别是宣布了拿破仑强加给他们的新税法和征兵法之后，威斯特伐利亚处于风雨飘摇之中动荡不安。拿破仑不得不在威斯特伐利亚保留数千驻军，而不敢将他们抽调到奥地利战场；后来又成立了20；000人的第十军团，先由朱诺指挥，后来由克勒曼指挥。
由于欧洲的局势动荡以及和奥地利人的开仗，拿破仑曾命令他的弟弟热罗姆的军团立即向德累斯顿挺进。瓦格拉姆战役之后在那里相继发生的战役中，朱诺被打败，热罗姆也被打得落荒而逃。当拿破仑得知德累斯顿失守、热罗姆和他的整个“皇家随从”逃回到卡塞尔舒适的城堡的消息后，他对热罗姆狠狠地进行了一番训斥：
我刚刚看到你签发的一道命令，它将使你成为德意志人、奥地利人和法国人的笑柄！难道你身边就没有能够劝告你、告诉你一点真情的朋友吗？你是国王，是法国皇帝的弟弟，在战争中这些都没有多大作用！你首先应该是一名士兵，然后是一名士兵，最后，你还是一名士兵。不要让大臣、外交使团对你前呼后拥，不需要夸耀。你应该和冲锋陷阵的士兵在一起，日日夜夜骑在战马上；你应该身先士卒，随时把握变化多端的战局。可是你却把作战当成了做总督！老天爷，你没有从我身上学到什么！我率领的是一支20万人马的大军，可我依然是一马当先……别把你自己弄成了一个天下最大的大傻瓜吧！将你的外交使团打发回卡塞尔去吧，出征不要带上你的行李车，只带上你随身需要的东西即可。你在战斗中应该像一名年轻的士兵，是一名追求光荣和荣誉的士兵，要为自己的身份增光，要为法国和欧洲的名誉而战，人们在注视着你的一言一行。
第三十章 瓦格拉姆（5）
此时祸不单行，西班牙发来紧急报告，法国人和英国人又在西班牙发生冲突；德意志发生大规模的叛乱，柏林、俄国和奥地利发生反法运动；富歇警告说，英国远征军计划在北海的岛屿沃尔切伦登陆，矛头显然是针对富拉辛和安特卫普。接着教皇也被解往法国南部的萨沃内监禁起来。事态变得异常复杂，一切都乱套了。
法国的谈判大臣香巴尼继续在阿尔腾堡与奥地利的梅特涅进行谈判，拿破仑不断给奥地利施加压力，正如奥地利亲王警告的那样：“拿破仑只谈一件事，那就是分割奥地利，建立几个分散的独立国，逼迫弗朗西斯退位。”这样的条件自然遭到哈布斯堡统治者的拒绝。“哈布斯堡王朝的毁灭将是整个欧洲的灾难。”沙皇也直接这样向拿破仑请求。
新近成为奥地利驻法国大使的梅特涅恳求法国外交部长香巴尼：“让我们参加你们的大陆体系吧，这样你们就可以对我们深信不疑了”——但是，千万不要让弗朗西斯退位，也不要分割伟大的哈布斯堡王朝——“这是谈判的基础，我们保持了荣誉，你们获得了实惠，这样就可以建立和平关系了”。
拿破仑和香巴尼对法国的盟友俄国和波兰十分不满。“俄国对奥地利没有打一枪一炮；事实上，只有波兰人参加战斗，流血牺牲。” 法国外交大臣对拿破仑抱怨道。俄国私下同意站在奥地利一边。因此，颇有远见的梅特涅力劝弗朗西斯暂忍胯下之辱，与法国签订和平条约，争取时间，等待时机到来。他的这个劝告和亚历山大私下对他母亲说过的那番话不谋而合。“我们的原则并没有改变，”梅特涅对弗朗西斯说，“但我们必须面对事实，我们没有别的选择，只有保留力量，等待时机到来，同时逐步地做好一切准备。” 和法国人签订和平条约是权宜之计，目的是有朝一日彻底推翻法国入侵者。
法国的可靠同盟波兰，已经向法国大军输出了成千上万的自愿军，目的是今后在自己国家独立的问题上能够得到拿破仑的恩准，可拿破仑却私下通知香巴尼，他对波兰问题另有打算，香巴尼后来将此事透露给了科兰古②：
皇帝陛下不仅不愿意看到波兰的再生——这和他的意愿相去甚远，而且他有意和亚历山大一起尽一切可能消除波兰人心灵中对这一愿望的记忆。皇帝陛下所要做的是使“波兰”和“波兰人”这些词汇不仅从谈判桌上消除，而且从欧洲的历史上消除。
这些想法在拿破仑后来的行动中表现了出来。
在谈判结束之前，普鲁士国王就暗中寻求能重整旗鼓对付法国人的同盟，特别是与俄国同盟。他在给亚历山大的信中写道：“如果您能从自己国家的利益出发，调整您现行的外交政策，宣布俄国反对法国的话， 陛下，形势将会如何不同啊！”虽然小心谨慎的亚历山大现在拒绝和任何国王联系，形势依然非常明朗：眼下，普鲁士、俄国和奥地利都不准备和法国在战场上一争高下，而是为将来做好准备；为此，在梅特涅的劝说下，奥地利国王弗朗西斯只能忍辱批准“临时”的和平条约——第二次多瑙河战役就此告终。
经过几周的谈判和讨价还价，1809年14日，双方在肖恩布鲁恩宫签订了和平条约；奥地利割地42；000平方英里，战争赔款8；500万法郎；而且奥地利必须将军队人数限制在15万人以下。
尽管法国万般威逼， 弗朗西斯总算保住了王位，只是权力大大削弱了，奥王为此十分气恼。俄国沙皇由于没有分到波兰的加利西亚而觉得受到了背叛和欺骗，而普鲁士国王更加坚定了打垮法国和拿破仑的决心。拿破仑在瓦格拉姆平原上“胜利”结束了第二次多瑙河战役，但同时也为他自己最终的灭亡埋下了种子。
拿破仑之所以在谈判中对奥地利拼命施加压力，是因为英国国王乔治三世准备派兵在比利时和荷兰海岸登陆。英国的军事行动一旦成功，将使拿破仑腹背受敌，难以招架。因此，他要预先给大不列颠的盟友一个精神上的下马威——这样，英国军队即使登陆，也将得不到来自柏林或维也纳的援助。
英国箭在弦上的架势使拿破仑的帝国深感不安，这种恐惧是来自奥地利的威胁无法比拟的，同时也使法国政府发生了从未有过的分裂。
这一切发生在上一年（1808年）的冬天，富歇向政府报告英国有军事准备的动向，这个报告被海军上将德克里斯和陆军大臣克拉克否决了。对拿破仑无限忠诚，却胆小怕事、谨小慎微、优柔寡断的首相康巴塞雷斯受到众大臣的全力支持，也否决了富歇的报告。是富歇又在捕风捉影，还是他另一个阴谋的前奏？在巴黎，甚至没有人信任富歇的邻居或同事。
可是，几个月之后，越来越多的报告证实了富歇的判断正确，克拉克也同意在斯凯尔特河沿线展开一系列的战役，德克里斯则派出了海岸巡逻舰——但仅此而已。
第三十章 瓦格拉姆（6）
1809年5月16日，拿破仑在维也纳发布敕令，废除教皇世俗权力，宣布将教皇领地并入法国；接着在7月6日，拿破仑绑架了曾将拿破仑逐出教会的教皇庇护七世。这样一来，本来就对拿破仑不满的欧洲，彼此的矛盾更加激化。
1809年4月，随着第二次多瑙河战役的展开，路易·波拿巴写信请求拿破仑出兵保卫他的荷兰王国，该请求遭到拿破仑的拒绝。因为拿破仑自己已经到了招募青年学生和退役老兵并将法国在各地的驻军抽调一空的境地，荷兰全境竟然就只剩下9；000法军驻守。
就在此时，富歇的警告得到了完全证实。1809年7月29日，急件传到法国首都，称英国舰队已经到达荷兰海岸，准备登陆。是一支舰队，而不是几艘军舰几百人（同年威尔斯利爵士曾率领13；000人在葡萄牙登陆，在伊比利亚半岛两次击败法军）。这次，英国264艘军舰运送着40；000人在沃尔切伦岛登陆了。
在富歇的敦促下，当天，康巴塞雷斯在杜伊勒里宫举行了军事会议。会议决定调集当地国民警卫队并在几天内武装30；000名平民，由被拿破仑从奥地利战场上驱逐回来的贝纳多特任总指挥前去抗御英军。为什么要找贝纳多特？富歇解释说：除了他找不到第二个指挥过军团作战的人。
8月12日，拿破仑在维也纳得知此事时，对大臣们不顾富歇的早期警告玩忽职守非常不满。他指责康巴塞雷斯：“的确太不负责任了。”并要他马上武装80；000人，“让英国人看到法国人是随时准备拿起武器反抗他们的”，从而挫败英国人的远征计划。他命令康巴塞雷斯：“别让英国人乘虚而入！”他申斥陆军大臣克拉克——至于富歇，“他做了你们自己应该做的事”。
法国军队和国民警卫队很快就出动前去应敌。英国人在其无能的指挥官查塔曼的错误指挥下，没有能够达到占领安特卫普的目的、被迫退到沃尔切伦之后，4；000人在沼泽地死于疾病，106人在战斗中牺牲。大部分英国军队于9月30日在舰队的掩护下，安全撤离。英国人的登陆没有像葡萄牙那次一样取胜，主要由于其指挥官的失误，而不是法国人的早有防备。
英军入侵沃尔切伦和南贝弗兰德，使路易和拿破仑的关系破裂到了出乎预料的地步。拿破仑责骂路易直接插手指挥在荷兰的法军对英军的作战。 “我是否可以认为我受到了极大的羞辱？”路易反驳道。“你这完全是在伤害你自己和你的王国，这对你陛下的伤害远超过你自己的想像。” 而拿破仑闪避地回答，“你倒霉的荷兰王国肯定有权对你怨声载道，它至今为止所遭到的苦难，完全怪罪于你个性的不稳定以及你对自己采取的措施缺乏正确判断。”
拿破仑为了要使由于他连年征战而四分五裂的欧洲求得稳定而决定不惜一切手段。他将历经数个世纪、经受了时间考验的地理区域结构彻底夷为平地之后，要用他自己一手制造的新的区域结构来取而代之，而这些新的结构都是草草构筑而且设计低劣的。现在，拿破仑通知路易将要让他下台，并将荷兰并入法国的