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两名差役和一名解官押着陆圻上了—只船，仆人张煜背着个包袱紧紧跟在后面，夫人孙氏和两个儿子也上了这条船。三弟陆堦和仆人褚礼上了另外一只船。两船解缆，沿着运河艰难地向北行驶。
时值腊月，运河的水冷凝冻冽，天空堆积着浓黑的冻云。大地笼罩着沉沉的寒烟，船像半僵的爬虫缓缓地爬着，两岸的昏鸦茅舍时隐时现，挣扎了一天，船靠了嘉兴码头。
陆堦登岸，叫了一桌酒菜，摆在陆圻乘坐的船上，陆圻、孙氏和两个孩子围拢来。陆堦说：“大哥大嫂，相聚时日不多了，和孩子们饮一杯团圆酒吧！”
一句话说得孙氏泪水断线珠子似的，轱辘辘滚在酒杯里，陆桂、陆寅也忍不住掉下泪来。陆堦为了冲淡这悲凉的气氛，端起酒杯：“嫂子，喝杯酒吧，祝大哥一路平安！”
孙氏强忍住泪水，浅浅饮了一口酒：“此去京都，千里迢迢，你大哥生性懦弱，多愁多思，你要多多开导大哥，让他放宽心胸，他的衣食起居，都托付给三弟你了。”
陆堦连连点头：“请大嫂放心！”
陆圻挨着妻子坐下，深情地说：“你带孩子回去吧，不要再教我心里难受了，你们走了，我心里会平静些。我遭此一劫，几弟兄都跟着受苦，我总觉得对不起他们。不论什么事，要为他们着想，你是长房大嫂，吃亏包涵都在你身上。”转脸握住两个儿子的手说：“我不在家，一切听从母亲的安排，要孝顺，要仁爱，处处谨言慎行。以后不必读书，不要学我这样……”
孙氏在陆圻的再三催促下，带着两个儿子离船登岸，依依不舍地上了码头，回望站在船头的陆圻，四双眼睛蓄满了泪水。船徐徐离岸启航，人影渐渐消失在灰黯的夜色中，母子三人楼抱在一起，哀哀痛哭。
三天之后，船到镇江码头，停泊在金山脚下。陆圻走出船舱，一立船头，悠扬的钟声响彻云天，朝日的霞光笼罩着金山寺的姿影，楼亭殿阁忽隐忽现，像是云天仙境。陆圻闭目凝神，暗自祈祷。耳中有庞然的嗡嗡声，像天风、像古雨，涌动着无边无际的轰鸣。此时陆圻胸中蓬勃着的，是一个虚无的世界。
11
康熙二年一月十九日，陆圻被解赴北京三十四天之后，官兵抄了陆圻的家。
这天一早，孙氏带女儿到后院佛堂收拾神像，见神像个个愁眉苦脸，与往日迥然不同。孙氏将自己的感觉说给了女儿，女儿却说不出有什么两样。各房小婶们陆续来到佛堂帮助收拾祭器，也都说看不出有什么异样。孙氏惊疑不定，心里恶恶怏怏，忙叫来小儿子陆寅，教他到奎山庵求签问问吉凶。
孙氏和妯娌继续收拾佛堂，忽然有人高喊：“纪老爷到！”一个衙门里的小官，拿着一纸书简正站在院子中央，一百多名官兵和差役一拥而入，为首的一名官员并不是纪元。孙氏正惊疑不定，二太太对孙氏说：“官兵来抄家了，北京的事，坏了！”
几十名官兵把房门一个个推开，高喊：“女眷，到院子集中，听总捕毛老爷点名！”
众人不敢怠慢，东西两院各房的女眷和丫环婢女都挤在院子中心，官兵差役团团包围如临大敌。
孙氏极力把持住自己的慌乱心情，把身旁的小女儿莘行交给二太太，冒称二太太的孙女文姑，如果死刑只限直系，这样就可以保住一条性命。
毛总捕挨个点名询问，让书办登记造册。陆家近邻许周父，往日陆圻经常周济他们一家，在这个紧要茬口，他端着一碗浆子，在各个门上遍贴封条，而且不断向毛总捕告密：某某是某人的儿子；某某是某人的仆人，意思是不能放过他们。这个势利小人，向官府大献殷勤，以为陆家已彻底翻了船，万劫不复了。毛总捕见他自愿效忠，就把陆家的两匹白布、三石大米赏给了他，让他作向导赴京，去捉拿老三陆堦。许周父二话没说，高高兴兴上路了。
陆家三十余口被关押在总捕班房，男人垂头丧气，女人孩子拥挤成一团，个个心惊肉跳，默不作声，一天水米未进，谁也不觉得饥渴。二太太的孙子禹川，点名时藏在奶奶的身后，没被官兵发现，人犯名单上没有写他的名字，可是也被裹携着捉来了，一名小吏带两名差役送来了一桶米饭和一桶菜汤。二太太问：“您老爷贵姓？”
小吏说姓朱，二太太说明原委，求这位朱老爷积德，把孙子禹川救出去。
朱某皱起眉头，沉吟了半天，瞅着眼前的孩子：“花名册上真的没有他？”
“真的没有，朱老爷看看册子就知道了。”
朱某进了后院，大概去看名册了，过了很大工夫才同一名差役回来，看着四周无人，把一领稻草帘子铺在地上，让禹川躺到上面，卷了个结实。差役弯腰抱起，挟在腋下。二太太讲清了送的去处，当即趴在地上磕了三个响头。朱某并不吭声，带领差役快步出了总捕房。
陆家男女老少无不称赞朱某人的侠肝义胆，痛骂许周父落并下石，丧尽天良。当夜更深，班房窗外有两个人轻轻呼叫，孙氏辨出了声音，一个是长女芰行的公公吴锦雯，另一个是自己的弟弟孙字台。吴锦声悄悄说：“大嫂，千万不要难过，眼下陆寅还没有被捕，我想把他藏在朱进修家，给你们留条根。”
孙字台从窗棂缝里伸进手来，抓住姐姐，哭泣着说：“兄弟是个无用之人，不能拯救姐姐，就让寅儿藏在我家吧，我会保护好他的。”
孙氏连说不可，“官府正在追捕陆寅，应该催促他赶快投案自首，千万不可因他一人连累大片亲戚。”二人无奈，只得连连点头，挥泪而去。
一月二十日，也就是陆圻家出事的第二天，官兵抄了查继佐、范骧的家，逮捕了一百四十余口。
因去奎山庵求签躲过逮捕的陆寅，主动投了案，母子见面抱头痛哭。有人报怨陆寅不该自投罗网，陆寅流着眼泪说：“全家都被杀了，我活着还有什么意思！”
按照刑厅规定，女子被送羁候所监禁。长发被剪掉。裤带、钗环被收缴，以防自尽。男子被发送按察使监狱。一进监狱，狱卒就给人犯一一戴上镣铐。
由于惊吓和劳累，刚刚躺在墙角的陆桂，哇哇吐了两口鲜血，他抓住弟弟陆寅的手说：“你这一来，咱长门绝后了。”
12
康熙二年正月二十日，在湖州、吴江等地进行大逮捕。刑部派来的满官吴努、戴肃哈带领旗兵和绿营兵几百人来到湖州，进城后立即关闭城门，会同城内文武官员分头密拿。
官兵悄无声息前进，突然包围了李令晳的家。李家父子兄弟男女主仆几百口全部被捕，还有拜年的亲戚和串门的邻居，也都被捆绑登记押往杭州。年前庄允城被捕押往北京，李令晳胆战心惊，赶紧把表弟陈紫松找来，让他火速进京找吴之荣疏通，请求他把序文撤去。李令晳与吴之荣有旧交，自以为吴之荣会讲点情面。陈紫松到京送给吴之荣一千两银子，吴之荣满口答应，李令皙自觉已经化解，高枕无忧了，殊不知像吴之荣这种狼心狗肺的东西，哪里还讲什么友情？
湖州府学教授赵君宋，是第一个将《明史辑略》案公布于众的，这个聪明反被聪明误的家伙，搬起石头砸自己的脚，全家十几口被捕。为他将案情处理经过申报给学道的两个学官也同时被捕。
湖州新任知府谭希闵，刚接前任陈永命印，没有几个月，也全家被捕。去年冬初，刑部派满官罗多来调已劈的《明史辑略》书板，潭希闵根本不知道此事，罗多找来库吏周国泰询问，受庄允城贿赂的周国泰说，陈知府交盘册上已写明有庄允城家《明史辑略》书板一副。其实，官场中主官交接时，都是属员亲手办理验看，主官只让人在交盘清册上盖印，并不详知具体情况。当时罗多申斥他知情不报。谭希闵觉得罗多是上司又是满官，忍气吞声没有申辩，认为不是大不了的事，出乎意料，这竟招来一场大祸。
湖州推官李焕，曾在赵君宋的通报文书上批写了“这部书虽呈通政司、礼部、都察院，已非秘书”的话，罗多来调查案情，申斥李焕捏造三衙门文书。包庇罪犯。李焕是个严谨认真的人，据理力争，说亲眼看到三衙门文书。罗多没话可说，不再往下深究。孪焕认为情由已辩解清楚，与己无关。其实，罗多要掩盖三衙门批文实情，官官相护，杀人灭口。这一来李焕也全家被捕。
分守道张武烈曾痛骂吴之荣，并把他驱逐出湖州。吴之荣恨得咬牙切齿，当然不会放过。这次也全家被捕，罪名是包庇谋逆犯庄允城。
庄允城被解往北京之后，他的儿子庄廷钺也被捕，并未解往北京，让县学收管，县学没有监狱，县学训导王兆祯让庄廷钺住在县学里，由门房看管。庄廷钺心系父亲安危，觅保请求释放。出头具保的五个人都是参加校订《明史辑略》的有功名的人士，县学要求增加一名没有功名的人。有一个叫戈明甫的，出于对庄允城感恩，主动愿为庄廷钺作保。县学将庄廷钺释放，庄廷钺连夜进京。到京后庄允城已在年终死于狱中，庄廷钺收尸后又回归本县投到。这次训导王兆祯以纵放要犯罪名被逮捕，作保的六个人也全部被捕。
庄允城家老老小小、家奴婢女全部被捕，包括庄廷钺二十四岁的妻子、四岁的儿子。
庄允城父子被捕时，同在南浔居住的朱佑明心里惶惶不安。过了一段时间自己仍安然无事，认为此书既然与自己毫无瓜葛，不可能无端株连，于是放下心来欢度新年。哪料想这次天降横祸，全家被捕。朱佑明仔细琢磨，诬告自己的只能是吴之荣，一连打了自己几个嘴巴：“老奴才，太吝啬，才落得如此下场。”对大儿子念绍说：“我不听你的话，害了你。”又对二儿子彦诺说：“你也和我一样，是个吝啬鬼！”
家住南浔的书商陆德濡，这天正办喜节，打发女儿出嫁，亲朋熙熙攘攘，旗兵突然闯入宅院，陆家和贺喜的几百人全部被捕，割工汤达甫、刷匠李祥甫也被捕。
吴江县县官和司理亲自率官兵来到江村吴炎家搜捕。吴炎毫不畏惧，把妻妾子女一一招呼出来。县官悄悄对他说：“你的小儿子可以藏起来，何必送死呢？”吴炎说：“我为真理而死，全家为我而死，没有什么遗憾！”
距吴炎家不远的潘柽章，也同时全家被捕。
原来在湖州任知府的陈永命，年前冬天被罢官，行至山东台儿庄，听说吴之荣出首逆书，因自己包庇庄允城，劈毁书板，自知其罪难逃，畏罪自缢，死在旅店里。他的尸体被砍成三十六块。他的弟弟陈永赖，任江宁知县，也罪在不赦受哥哥株连，全家被捕，押至杭州监狱。
在山西朝邑县，县官茅元铭上任不久，因参校逆书，全家被捕，解至杭州。
苏州阆门里一家书铺主人因卖《明史辑略》被捕。浒墅官货栈主事李尚白，曾派差役到该书铺买《明史辑略》，正赶上书铺主人不在，差役坐在书铺邻居朱某家等候。书铺主人回来，朱某为他们商定书价。李尚白和七十多岁的朱某都被逮捕，押送杭州，德高望重的督学两浙的黎博庵，因《明史辑略》提到他的名字，同一天，也全家抄没。
大逮捕在同一天进行，以杭州为中心，共逮捕了两千多人，集中关押在旗兵兵营内。
13
康熙二年正月二十四日，陆圻被押解到北京，和査继佐、范骧等分别囚禁在刑部牢房里。三弟陆堦及时到京，在刑部牢房近的旅店住下，借探监的机会给狱卒使了银子，求他们多多照顾。
为了寻找关系和门路，在外跑了一整天，这天傍晚回家，发现仆人张煜席卷了三百多两银子和衣物，逃之夭夭。这一棒打得陆堦头昏眼黑，瘫软在地上站不起来。褚扎大骂张煜无情无义，要上街寻找张煜，将他扭送官府。陆堦连连摇头：“到哪里去找，岂不是大海里捞针？”
主仆二人胡乱吃了点东西，垂头丧气地过了一也，第二天清晨，陆堦亲自去找舅舅裘信甫。裘信甫做官多年，岁数大了，养尊处优轻闲无事。陆堦直接走进裘家客厅，见舅舅端坐在太师椅上，一脸肃穆，客庁里笼罩着严峻的气氛。陆堦向舅舅请了安。
裘信甫问：“什么时候到京的？”
“前天。”陆堦说着，流下泪来，哽哽咽咽，泣不成声，“大哥……他犯案了……”
裘信甫用手按了按陆堦：“不必说了，我知道了。”停了一停，又说“家已抄了，全家被捕，你还不知道吧？”
陆堦一听，像五雷轰顶，摇摇晃晃，坐不住位子：“我离家二十多天了，家里的事一无所知，舅舅是怎么知道的？”
“刑部有人把消息透给了我。你大哥怎样？”
“我随他一同到京，前天已关进刑部牢房，吉凶未卜。”
“丽京一贯谨言慎行，怎么参与了这种事情？”
陆堦心想，舅舅只知道大哥犯事，并不知道�