对于朝鲜王国六镇周围的女真人，布占泰也想如努尔哈赤的办法，收为羽翼，而努尔哈赤从万历二十六年（公元1598年）收服内河路、安兹拉库路，第二年又收服窝集、虎尔哈等部，大有吞并东海各部之势。他在暂短的时间内，几乎把朝鲜会宁以西的各部女真都收归了建州，兵力大为增强［31］。对此，乌拉布占素心急如焚，生怕东海各部都被建州夺去。所以，万历三十一年（公元1603年）九月，布占泰兵分三路。以二路向钟城进攻，将东海钟城近地的女真各部“焚盪”无遗，获取牛、马五百多匹，男、女人口数以千计［32］。同年十二月，又以大兵向稳城女真进攻，并直捣庆源周围，大掠而归［33］。
乌拉首领布占泰的卓见就在于他善于审时度势，既坚持军事戟，又采取灵活的外交手段。他看到努尔哈赤在统一战争中逐步强大起来，其办法之一就是掠取诸部，把会宁以西女真各部人口尽量地移人建州腹地，实力越来越强。因此，布占素也如此办理，向钟城、稳城、庆源周围的女真各部进兵，“踵老酋之后”，大掠朝鲜六镇“藩胡”，致使乌拉部兵将和人口激增，势力渐大［34］。
布占泰力量不足，每出兵必请叶赫、蒙古各部协助，因此，攻势迅猛［35］。到万历三十四年（公元1606年）七月，布占泰的兵锋所至已达悬城女真各部了，并且水、陆并进，人、畜、谷物等尽行掠取、迁移［36］。万历三十五年（公元1607年）正月，又发兵攻取瑚叶路（今苏联东滨海省境内达乌河流域）诸部，一个时期，六镇周围及其东北各部女真都听从布占泰的号令。
乌拉布占泰在军事上一系列的胜利，早已引起努尔哈赤的严重关注，凡是布占泰的动静，不论事情大小，努尔哈赤都侦察入微，并且及时的向广宁总兵通报。目的是既取得边官的信赖，也为自己采取军事行动寻找借口和扫清障碍。因此，乌拉部与建州部在东海女真问题上已经酝酿着一场大的冲突。为了进一步排除进军东海女真各部的阻力，努尔哈赤通过外交途径，求得朝鲜王廷的谅解。以布占泰受朝鲜王廷的“职贴”为名，努尔哈赤也派遣一名副将到满浦镇，请朝鲜国王以对待北方“藩胡”的惯例，乞求到朝鲜王国京城受职。朝鲜国王以努尔哈赤受明廷龙虎将军重职，非一般首领可比，而婉言拒绝了［37］。成历三十五年（公元1607年），乌拉部与建州部终于在争夺朝鲜王国六镇“藩胡的问题上爆发了战争。这一年，东海瓦尔喀斐优城（今吉林省珲春县三家子公社高丽城村）主策穆特赫来到建州，向努尔哈赤表示：我部遥远，不得已归附了乌拉部，希望派兵前去接取家眷，愿意到建州来生活。同年三月，努尔哈赤命令其弟舒尔哈齐贝勒、长子洪巴图鲁（即褚英）贝勒，次子代赞贝勒与大臣费英东、扈尔汉等，率兵三千向斐优城进发。从派遣的将领看，努尔哈赤对这次行动相当重视，对其后果也并不是没有考虑的。斐优城近朝鲜的悬城，建州兵到斐优城以后，把城周围屯寨的居民近五百户，全部收来［38］。同时，致书朝鲜王国边镇官员，说明这次出兵没有侵犯王国的意思，相反，还归还了部分被掠来的朝鲜王国的人口，表示友好。书中要求凡是进入朝鲜王国的女真人，希望送还给建州部［39］。努尔哈赤的这一外交行动，进一步为建州进兵扫清了道路，使朝鲜王国边防军保持中立。
舒尔哈齐贝勒等收取五百户以后，命令费英东、扈尔汉先率兵三百，护送先行，当护送队伍走到钟城地界时，突然受到万名乌拉兵的阻截，处境十分危急。费英东、扈尔汉立刻采取紧急措施，一面急令五百户结阵于山巅，即朝鲜人所称的乌碣岩，以一百兵守卫。另以二百兵与乌拉兵相峙。同时，驰报后继诸贝勒。第二天，乌拉兵前来挑战，建州大将杨古利率众奋勇迎击，阵斩乌拉七人，乌拉兵被迫后退了。两军各自隔江扎营。傍晚，舒尔哈齐等后继众贝勒赶到。褚英、代善见众兵畏敌，便鼓励士兵说：乌拉布占泰是我军的俘虏，曾经铁锁系颈，免死以后放回去的。他的兵虽然多，我们有汗父素著的威名，这一仗我们必胜无疑。众兵听后，欢跃振奋，士气大振。
第二天的上午，乌拉与建州两军接战。乌拉大将博克多贝勒父子率先冲阵而出，战不几合，被代善生擒过来，父子都被斩于马下。次将常住、胡里布也战败被擒。乌拉众兵见主将失利，纷纷溃散［40］。建州兵随后勇猛奋击，交战十分激烈。自午时战至日暮。建州兵势如摧枯拉朽，乌拉兵死伤累累，仅死于朝鲜王国境内的就近三千人，战死在女真地方的也有五、六千人，合计有七、八千人［41］。战后，建州获得马五千匹，甲五千副，大获全胜。这就是有名的乌碣岩大战。
大军凯旋后，努尔哈赤奖励战将，各赐以名号。舒尔哈齐被赐名为达尔汉巴图鲁（蒙古语，荣誉的勇士）。长子褚英奋勇作战，赐名为阿尔哈图图们（蒙古语，有智谋的万户），代善与其兄并力杀敌，擒斩乌拉主将博克多父子有功，赐名为古英巴图鲁。
乌碣岩大战使乌拉与建州两部的力量对比发生了有利于建州的变化。战前，乌拉兵力盛于建州，战争中努尔哈赤的军队既消灭了乌拉的有生力量，又收编东海女真兵多达五、六千，作为心腹，兵势之盛，雄于诸部，各部女真纷纷归附。乌拉部的士气大挫，从此。对建州兵不敢轻易迎锋了［42］。。
在乌拉与建州矛盾日益尖锐的情况下，布占泰深感力量不足，便与叶赫部进一步携手，与科尔沁蒙古密切关系，以对抗建州。万历三十六年（公元1608年）三月，努尔哈赤令长子褚英，侄儿阿敏率兵五千，前去攻击乌拉部的宜罕山城，斩杀了一千多人，得甲三百副，城中人、畜都被收过来。建州大军回来时，布占泰贝勒虽然与科尔沁翁阿岱合兵追出了乌拉大城二十里，但未敢迎战，眼巴巴地看着建州兵返程了［43］。
万历四十一年（公元1613年），乌拉布占泰与建州努尔哈赤的关系，随着建州统一事业的发展，进一步恶化，终于爆发了导致乌拉部灭亡的战争。战争的具体原因是，努尔哈赤虽然三次嫁女给布占泰，结其欢心，结果却使努尔哈赤大失所望。因此，努尔哈赤指责布占泰七次背盟。同时，建州奴隶主集团独占了北方貂、参、珠等之利，使开原人与叶赫人大为不满，他们彼此相谋说：将努尔哈赤与叶赫约婚的老女，转嫁给乌拉布占泰，挑起乌拉部与建州部之间的冲突。布占泰早已内心倾向叶赫部，对于建州奴隶主们压低貂、参价格，不给平价颇有怨气。又知道叶赫老女为当代的绝色，叶赫部主动送来衣服、鞋子等物，便对建州三女逐渐疏远了，并以骲箭射努尔哈赤之女。建州三女不肯受辱，向努尔哈赤诉苦。加上布占泰又两次与建州争夺东海虎尔哈部，这就导致了两部进行最后的较量。
建州与乌拉两部继宜罕山城战后，再次发生冲突。万历四十二年（公元1614年）九月二十二日，努尔哈赤统率三万大兵向乌拉进发，二十九日抵乌拉境内，沿乌拉河行进。张扬黄盖、鸣号角，击鼓向前，以示兵威，直达乌拉大城的河对岸列阵。乌拉布占泰贝勒见敌兵大至，决定不与建州兵决战，采取白天出兵袭击，夜间收兵休息，以疲劳建州兵卒的战术。努尔哈赤的五子莽古尔泰、八子皇太极两贝勒，想渡乌拉河主动进击。努尔哈赤告诫说：你们所说的话，象浮面取水那样容易，凡是遇事都应当深虑。象伐大木吧，哪能一下子骤然折断，必须以斧子先砍，逐渐砍断。两个相等的国家，怎么能一举歼灭对方？于是，下令先将乌拉大城周围的各个小城攻占，以孤立乌拉城。又令军士纵火，把沿河六城的房屋、谷物全部焚毁。
乌拉布占泰见沿河六城被焚，财物尽被烧毁。接着又有五城失守，而建州还没有退兵的意思，十分着急，便派遣大臣吴巴海巴图鲁乘船到努尔哈赤军营的对岸，对建州使臣说：汗父兴兵到此，不过是一怒之下而为之。今天敬请息怒，可否留下话退兵。努尔哈赤对于乌拉来使不予理睬。布占泰贝勒三次遣使求和，努尔哈赤都不肯接见。布占泰贝勒只好亲自率领六员大将，乘船前来拜见。努尔哈赤得知布占泰前来求见，便身披明甲，胯下骑着白马，从军中走出，步入乌拉河，水至马腹，站立河中。布占泰看见汗亲自出营，慌忙叩头，恳求说：乌拉部就是汗父的部，乌拉的谷也是汗父的谷，请不要焚烧谷物。努尔哈赤严厉地责问：布占泰！先前擒你在阵上，将你已经该死的身子，宽释出来，厚养款待，扶为乌拉国主，以我三女配给你作为妻室。今日你欺骗、蔑视我部，七次违背盟誓；掠夺我的属部虎尔哈；想强娶我所约聘的叶赫女子；以骲箭辱射我女儿。又教训布占泰说：我爱新觉罗的人，哪有被责辱的？百世以前你不知道，还有情可原，十世、十五世，难道你也不知道吗？我兴兵到这里，难道是没有缘故的，这受辱的名声，我怎么能藏于心中，含耻于九泉之下呢？俗话说，“宁削其骨，莫毁其名”。我并不是乐意兴兵弄武，听说屈辱我的小女，才提兵到此。布占泰叩头说：这事或许有人进了谗言，离间我们父子关系，使不得和睦吧！若是果然有射汗女，娶汗配婚女子的事，我在水上，下有龙神共鉴。布占泰的部将拉布泰扎尔固齐［44］插话说，汗有如此之怒，只派一位使者来责问就可以了，何必兴师动众。努尔哈赤大怒说：拉布泰！我部下难道缺乏象你这样才能的人，用你来喋喋不休？辱射我女儿的事，难道还用再查吗。娶我的约婚，事已属实，不必再问。这乌拉河难道没有结冰的时候，我兵哪有不再来的道理。到那时，你拉布泰能挡住我的刀吗？布占泰听后，大惊失色，制止拉布泰说：无须多嘴！布占泰的弟弟喀尔喀玛感到事已难于分解，就恳求说：请汗宽恕原谅，可否听汗一言而定。努尔哈赤说：你布占泰若真的没射我女，没有谋娶我的约婚，可将乌拉部众大臣和你的儿子送来我部作为人质，否则，没有凭信。说完转身回营了。大军留住乌拉五天，在乌拉河边鄂勒珲通乎玛山下做木城（今伊通县赫尔苏城）屯兵千人［45］。
万历四十一年（公元1613年）正月。努尔哈赤见乌拉布占泰不仅不送人质到建州，反而将女儿萨哈廉、男儿绰启鼐和十七大臣的儿子准备送往叶赫部，并决意聘娶叶赫老女，囚禁建州二女而大怒，亲自统率大军再征乌拉。因为哨探侦知乌拉部将于十八日送质子去叶赫部，所以，他们十七日提前一天抵达乌拉境内。乌拉兵不能抵抗，建州军连下孙扎寨城、郭多城、鄂谟城，当夜军队屯驻于郭、鄂二城（诸城皆在吉林城东北三、五十里之地）。
正月十八日，布占泰统兵三万，出富尔哈城迎战。努尔哈赤见乌拉兵出战，手下众将也纷纷求战。次子代善等愤然说：初战，唯恐布占泰不肯出城，相议设谋，引他出城。今天布占泰既然率兵出战，舍掉良机，我们兴兵到这里，厉兵秣马为的是啥？若是布占泰娶了叶赫的女子，我们蒙受了耻辱，虽然已经讨伐了乌拉部，又有什么益处？今天我们大兵到此，兵强马壮。应当传令将士，决一死战。努尔哈赤听了这些话，愈加沉静地说：两国交兵，必然我与众贝勒、五大臣、众将领身先士卒，我不是怕战，而惜爱众将，恐怕有一、二个受伤。众将听了努尔哈赤含有深情的话，求战情绪更高。努尔哈赤见此便进一步激励说：承蒙上天保佑，我自幼在千军万马之中，孤身冲突，矢刃交加，身经百战，从无惧色。今天，将何所畏惧。说罢，披甲将要率先出战。全军上下顿时欢声如雷，人人披甲待战。努尔哈赤决定破敌于城下。下令说，若是击败敌兵，可以乘势先夺城门。
这时，布占泰已经统率三万大军，严阵以待，两军已经逼近，建州兵下马相峙。初战时，两军弓箭手对射，矢如风发雨注，声如群蜂聚集，杀气凌云。努尔哈赤环顾众将以后，拍马舞刀猛然杀入敌阵，众贝勒、大臣，各统亲军奋力冲杀。乌拉兵抗不住建州大军潮水般地冲击，阵脚顷刻大乱。兵溃如山倒，乌拉兵纷纷弃甲、丢戈，四散奔逃。建州大将安费扬古首先冲到乌拉大城，竖起云梯，率先登城。待努尔哈赤杀到城下时，乌拉大城已经陷落。安费扬古迎接努尔哈赤从容入城，坐在西门城楼上观战。这时，建州各旗兵追杀乌拉兵于旷野，布占泰全军崩溃，损兵折将十有七、八，只率领百名亲兵，勉强脱身逃回。在慌乱之中，刚到城下，见城上建州大